为了促进学科交叉，开拓科研视野，荷兰鹿特丹伊拉姆斯大学Jose Alberto Nakauma Gonzalez博士应邀为师生进行生物信息技术应用的系列学术报告。具体通知如下：
报 告 人：Jose Alberto Nakauma Gonzalez博士
报告地点：食品学院五楼会议室
日程安排：
| 8月18日 | ||||
9:00 |
9:05 |
Welcome |
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1 |
9:05 |
9:20 |
Genomics, transcriptomics |
Introduction to NGS and bioinformatics |
2 |
9:20 |
9:40 |
Genomics, transcriptomics |
Data bases, repositories and genome visualization |
3 |
9:40 |
10:00 |
Genomics, transcriptomics |
NGS experimental design |
4 |
10:00 |
10:20 |
Genomics, transcriptomics |
Genome assembly and gene annotation |
10:20 |
11:40 |
Break |
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5 |
10:40 |
11:00 |
Genomics |
QC and mutational calling |
6 |
11:00 |
11:20 |
Genomics |
Significantly mutated genes |
7 |
11:20 |
11:40 |
Genomics |
Evolution and phylogenetic trees |
8 |
11:40 |
12:00 |
Genomics |
Microbiome and cancer |
| 8月19日 | ||||
9:00 |
9:05 |
Recap from Day 1 | ||
9 |
9:05 |
9:20 |
Transcriptomics |
RNA-seq QC, mapping, counting, batch effect |
10 |
9:20 |
9:40 |
Transcriptomics |
Bulk, single-cell and spatial transcriptomics |
11 |
9:40 |
10:00 |
Transcriptomics |
Basic data analysis: Clustering, deconvolution, differentially expressed genes |
12 |
10:00 |
10:20 |
Transcriptomics |
Pathway analysis |
10:20 |
11:40 |
Break |
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13 |
10:40 |
11:00 |
Transcriptomics |
Identify mutations in mRNA |
14 |
11:00 |
11:20 |
Genomics, transcriptomics |
Tools to perform simple data analysis and Figures for your papers |
15 |
11:20 |
11:40 |
Multi-omics |
Other (proteomics, methylation) omics data |
11:40 |
12:00 |
Recap from all the lectures and questions |
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报告人简介：
Jose Alberto Nakauma Gonzalez博士现任鹿特丹伊拉姆斯大学医学院研究员，长期从事生物信息分析和方法开发工作，对基因组测序、转录组测序、多组学数据分析、分子通路分析、计算机模拟和生物标志鉴定等方面具有专长。在2022年和2023年荷兰免疫学会会议上作报告并受到关注，在2022年和2023年荷兰生物信息学与系统生物学会议上报告了团队最新成果。此外，2022年和2024年作为特邀专家为荷兰生物信息学与系统生物学研究学校开设了关于免疫表型分析的课程，主要涉及大规模RNA-seq数据分析和挖掘。
食品科学与工程学院
2024年7月9日
